Gaubert fut jusqu’à la fin du XIXe siècle une commune indépendante de Digne.

Les pentes entre le Cousson et la Bléone furent occupées dès la Préhistoire et de nombreux restes de l’Antiquité (tegulae, céramiques, tombes,…) y ont été retrouvés.

Au moyen âge, le village s’installa sur la colline et était enserré de remparts. Le château se dressait au sommet de la colline, l’église et les maisons d’habitation à ses pieds.

Les seules parties de l’église primitive qui subsistent de nos jours sont celles qui étaient taillées dans le roc. Les bases des piliers sont encore bien visibles ainsi que quelques sépultures. À cette époque, le chevet de l’église était orienté à l’est. Ultérieurement, l’organisation de l’espace a évolué en occupant plus largement l’ensellement de Gaubert ; seuls subsistent quelques vestiges des remparts.